課程資訊
課程名稱
生物資訊學實習
Bioinformatic Lab. 
開課學期
100-2 
授課對象
生命科學院  生命科學系  
授課教師
阮雪芬 
課號
LS3006 
課程識別碼
B01 31060 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
星期四3,4,@(10:20~) 
上課地點
生科419 
備註
F群選擇必修。須先修過生物化學或基因體學。
限學士班三年級以上 且 限本系所學生(含輔系、雙修生)
總人數上限:10人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1002bi 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程主在介紹現今在生物資訊
領域的相關知識.課程內容包括:
Introduction, Biological
Databases, Analysis at the
Nucleotide and Protein
Level, Inferring
Relationships等,並進行現場操
作,讓學生熟悉生物資訊學軟體
及其應用。
 

課程目標
希望訓練學生利用生物資訊工具 進行其它課程的資料收集及分析 
課程要求
已修過生物化學, 基因體學或分子生物學 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
指定閱讀
 
參考書目
Bioinformatics: A practical guide to the analysis of genes
and proteins (2005), Andreas D. Baxevanis and B. F.
Francis Ouellette, Wiley-Liss (藝軒) 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/23  分配電腦及分組 
第2週
3/01  Biological Databases I: Sequence Databases 
第3週
3/08  Biological Databases II: Mapping Databases 
第4週
3/15  Biological Databases III: Information Retrieval from Biological Databases 
第5週
3/22  Analysis at the Nucleotide Level I: Predictive Methods Using DNA Sequences 
第6週
3/29  Analysis at the Nucleotide Level II: Predictive Methods Using RNA Sequences 
第7週
4/05  春假 
第8週
4/12  Analysis at the Protein Level I: Predictive Methods Using Protein Sequences 
第9週
4/19  Analysis at the Protein Level II: Protein Structure Prediction and Analysis 
第10週
4/26  Analysis at the Protein Level III: Intermolecular Interactions and Biological Pathways 
第11週
5/03  期中考 
第12週
5/10  Inferring Relationships I: Assessing Pairwise Sequence Similarity: BLAST, Creation and Analysis of Multiple Sequence Alignment 
第13週
5/17  Inferring Relationships II: Phylogenetic Analysis 
第14週
5/24  Inferring Relationships III: Fundamental Statistics of Biochip Analysis 
第15週
5/31  Inferring Relationships IV: Using DNA Microarrays to Assay Gene Expression 
第16週
6/07  Inferring Relationships V: Proteomics and Protein Identification 
第17週
6/14  期末考 (繳交期末報告)